1、从温控精度和热量分布均匀性来选择的。如果对产品的温度要求很严格，特别是出口产品，因为热量分布很均匀，要尽量选择全自动电脑控制杀菌锅。电脑半自动杀菌锅温控、压力控制与电脑自动相同。一般要求可以选择电动半自动杀菌锅。纯手动杀菌锅杀菌难度大，控温控压都是手动完成，食品外观难以把握，罐(袋)膨胀、破碎率高。

2、如果产品采用空气包装或产品外观比较严格，则应选择全自动或半自动电脑杀菌锅。

3、如果产品是玻璃瓶或马口铁，因为加热和冷却速度要可控，所以尽量不要选择双层杀菌锅。

4、如果考虑节能，可以选择双层杀菌锅，其特点是上罐为热水罐，下罐为处理罐，上罐的热水可以重复使用，可以节省大量蒸汽，适用于日产量10吨以上的食品生产企业。

5、如果产量小或者没有锅炉，可以考虑使用电-汽两用杀菌锅。其原理是下罐电加热产生蒸汽，上罐灭菌。

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